Возводился друхэтажным вдолькромки волжского обрыва от покоев архимандрита до больничного храма на 68 саженей длины и 3 сажени 1 аршин ширины, 12 марта 1652 г. архимандрит Герман сообщал в Мостку, что "братские кельи оне построили каменные", просил разрешиния на продолжение работ.

Высокая тесовая кровля корпуса регулярно подновлялась, в том числе в 1672 г. плотником Савкой-иноземцем. Особый вред протяженному зданию приносили осыпи берега из-за гниения укреплявших его деревянных обрубов. В 1704 г. сообщалось, что 15 обрубов здесь сгнили и "оттого братским каменным кельям учинилось повреждение". Серьезный урон корпусу принесли пожары 1743 и 1751 гг., когда не только выгорели деревянные части, но и "от жару в сводах и стенах появились расселины". В 1751 г. был произведен капитальный ремонт келий.

После сокращения штатов в монастырях (1764 г.), когда в Печерском было оставлено лишь 33 инока, часть келий оказались пустующими, долго не ремонтировались. В 1838 г. сообщалось, что "на всех братских кельях крыши все ветхи и покои многие стоят без полов и потолков". В 1840 г. ремонт корпуса провел А.Л. Леер. Последующие ремонты здания, в том числе 1870 г., изменений в его архитектуру не внесли.