Осуществлялась в общей системе Генерального межевания и переустройства города. С древних времен кремль был застроен плотно. В 1779 г. на его территории располагались 3 собора, 3 исключенных из штатов монастыря, развитый комплекс епископской резиденции, губернское правление, дом губернатора и более 200, преимущественно деревянных, жилых дворов. По утвержденному в 1782 г. плану сносились старые строения (в том числе каменный собор бывшего женского Вскресенского монастыря). В центре кремля, с ориентацией на Михайло-Архангельский собор, разбивалась площадь торжествований (плац-парад). По ее длинным сторонам планировались протяженные корпуса каменных присутственных мест и соединенные аркадой проезда к Спасо-Преображенскому собору 4 одинаковых дворца для высшего местного чиновничества: наместника, вице- губернатора, нижегородского и военного губернаторов (возведен лишь один).

Каменные соборы Симеоновского и Духовского монастырей сохранялись, но превращались в приходские церкви. Бывший митрополичий дворец у Спасо-Преображенского собора был реорганизован, а с 1786 г. передан под размещение Главного народного училища. Близ Часовой башни в кремле оставались государственные винные подвалы, у Дмитриевских ворот - пруд Сарка. Жилая новая застройка планировалась в виде вытянутых вдоль крепостных стен и по бровке Часовой горы улиц. Места для желающих отводились землемером Д.Поповым с выдачей на них планов, владенных указов и образцовых фасадов. В 1798 г. на территории кремля оставалось 62 жилых дома. Кроме того, там размещались каменные казенные здания присутственных мест, вице-губернаторского дворца, банковской конторы, бывшей епископской резиденции, солдатских казарм, архива и дома генерал-губернатора.