Сначала располагался в восточной части Нижегородского кремля, возле Спасо-Преображенского кафедрального собора. Был возведен в камне первым нижегородским митрополитом Филаретом в XVII веке, но многократно горел. При учреждении в Нижнем Новгороде Главного народного училища в мае 1785 года епископ Дамаскин (Д.С.Руднев) уступил развитый комплекс своей кремлевской резиденции под его классы. Но при условии, чтобы Приказ Общественного призрения построил взамен новое каменное здание на территории Иоанновского монастыря, где уже стоял возведенный архитектором Я.А.Ананьиным епископский жилой дом (улица Ульянова, 10а).

Проект архиерейского дома (28х10 саженей) создал Я.А.Ананьин в июле 1785 года. Нижние этажи были каменными со сводчатыми помещениями, третий деревянным. Крестьянин деревни Березники П.И.Шитенин тогда же доставил к месту строительства 468 бочек извести, городчанин В.Д.Семьянский - кирпич. Последний взял и подряд своей артелью возвести корпус. В 1786 году архиерейский дом был отделан, церковь - освящена. С северной стороны корпус получил навесные галереи. Церковь располагалась на втором этаже, над алтарем над кровлей поднялась главка с кованным золоченым крестом.

С мая 1827 года по проекту и под надзором архитектора А.Л.Леера здание было капитально перестроено: разобраны третий этаж, висячие галереи и быки-контрфорсы. Строительная артель крестьянина села Вершилово Е.А.Блинова к 1 октября 1827 года переложила своды церкви, по углам корпуса с северной стороны возвела две колокольни, но сохранила в решении фасадов дощатую рустовку первого этажа, а на втором - наличники с полочками на консолях.

В 1859 году по проекту И.К.Кострюкова архиерейский дом и парадные въезды на территорию его усадьбы были вновь перестроены. В 1863 году вместо двух звонниц с северной стороны здания была пристроена высотная шатровая колокольня с входом на второй этаж прямо в церковь. Над ярусом звона были смонтированы часы с боем.

Когда здание перестраивалось под консерваторию, был надстроен третий этаж, верх колокольни разобран.